Определена часть последовательности кодирующей цепи ДНК (состоит из 36 триплетов):
...ГАА ЦАА ГАГ ТАЦ ААТ ААА ЦАГ ГАА ЦАТ ТАЦ ГАА ГАГ ЦАГ ААГ ГАА ЦАА ГАГ ТАЦ ГАТ ААА ЦАГ ГАА ЦАТ ТАЦ ГАА ГАГ ЦАГ ААГ АГА ТТА ТГА ГТТ АГГ ТТГ ТГГ ГТЦ...
Воспользовавшись таблицей генетического кода, установите последовательность аминокислот в закодированном участке, и, по строению радикалов аминокислот, постарайтесь определить гидрофобные или гидрофильные свойства проявляет этот участок полипептида?
Исходя из строения, предположите, что из функций больше подходит для такого белка: внутриклеточный белок (например, фермент) или трансмембранный белок (например, рецептор)?
Какие последствия для функционирования белка будут иметь:
1) потеря нуклеотидов № 13, 14, 15
2) замена нуклеотида № 18 на "Г"
3) потеря нуклеотида № 29
4) замена нуклеотида № 14 на "Т"
Генетический код (иРНК)
|
Первое основание |
Второе основание |
Третье основание |
|||
|
|
У |
Ц |
А |
Г |
|
|
У |
Фен Фен Лей Лей |
Сер Сер Сер Сер |
Тир Тир — — |
Цис Цис — Три |
У Ц А Г |
|
Ц |
Лей Лей Лей Лей |
Про Про Про Про |
Гис Гис Глн Глн |
Арг Арг Арг Арг |
У Ц А Г |
|
А |
Иле Иле Иле Мет |
Тре Тре Тре Тре |
Асн Асн Лиз Лиз |
Сер Сер Арг Арг |
У Ц А Г |
|
Г |
Вал Вал Вал Вал |
Ала Ала Ала Ала |
Асп Асп Глу Глу |
Гли Гли Гли Гли |
|
Есть небольшое сомнение, которое закралось после чтения всяких разных (может даже и вредных) ссылок: всегда ли справедлив механизм ДНК-мРНК-РНК-АК? Где-то мельком встречалось, что этап мРНК - не всегда... Например, если транскрибировать двойную спираль ДНК - ведь в одной её половине будет, например, ГАА-ЦАА, а во второй - комплементарные ЦТТ-ГТТ, связанные водородными связями. мРНК с первой половины - ЦУУ-ГУУ, со второй - ГАА-ЦАА. С первой будут РНК: ГАА-ЦАА, со второй - ЦУУ-ГУУ. Смотрим аминокислоты: с первой - Глу-Глн, со второй - Лей-Вал... Какая тогда половина "правильная"? Или таки нужно предполагать, что оба варианта в сумме дают правильный ответ, и их оба надо просчитывать?
Я, вот, пока думаю, что в задачах дана именно только одна цепочка, и с неё идёт синтез как по букварю (ДНК-мРНК-РНК-АК), остальное пока где-то за рамками, но всё же интересно...
...ну ёлки-палки - протормозил, конечно, с последовательностью транскрипции, но всё равно - белки-то разные с двух половин получаются...
Определить последовательность аминокислот - недолго. Вот они:
Glu Gln Glu Tyr Asn Lys Gln Glu His Tyr Glu Glu Gln Lys Glu Gln Glu Tyr Asp Lys Gln Glu His Tyr Glu Glu Gln Lys Arg Leu Opal Val Arg Leu Trp Val
Определить гидрофильность, равно как и определить принадлежность к ферментам или рецепторам - надо больше данных. где почитать?
Поддерживаю Maximusa.
Последовательность аминокислот:
лей вал лей мет лей фен вал лей вал мет
лей лей вал фен лей вал лей мет лей фен
вал лей вал мет лей лей вал фен сер асн
тре глн сер асн тре глн
Большинство из этих аминокислот, если почитать про них подробнее, гидрофобные. Если же почитать про ферменты, то написано, что чаще они как раз гидрофобны (а рецепторы - гидрофильны). Значит, перед нами фермент.
Последствия для белка:
1. Потеря нуклеотидов 13,14,15 - пропадет 5-ый элемент - лей. Не знаю, на сколько критично выпадение одной аминокислоты.
2. замена нуклеотида № 18 на "Г" - в ДНК ААА сменится на ААГ, для иРНК УУУ сменится на УУЦ, но и УУУ, и УУЦ кодируют одну аминокислоту - фен. Поэтому такая мутация никаких последствий не будет иметь.
3. потеря нуклеотида № 29 - видимо, все нуклеотиды, начиная с 10-го триплета, будут компановаться по новым тройкам? То есть, до 10-го триплета последовательность аминокислот будет прежней: лей вал лей мет лей фен вал лей вал, а далее каждый первый нуклеотид последующего триплета становится последним нуклеотидом предыдущего триплета,чтобы "восполнить пробел" выпавшего 29-го? Если так, то получатся совсем другие аминокислоты (с 10-го триплета): АГЦ УУЦ УЦГ УЦУ УЦЦ УУГ УУЦ УЦА УГЦ УАУ УУГ УЦЦ УУГ УАА УГЦ УУЦ УЦГ УЦУ УЦУ ЦУА АУА ЦУЦ ААУ ЦЦА АЦА ЦЦЦ АГ, то есть:
- прежняя последовательность - сер
фен сер сер сер лей фен сер цис тир лей
сер лей --- цис фен сер сер сер лей иле
лей асн про тре про.
Получились совсем другие аминокислоты, видимо, функция белка будет утрачена.
4. замена нуклеотида № 14 на "Т" приведет к замене в иРНК УУА на УАА, то есть к замене лей на триплет, который не кодирует никакую аминокислоту. Как сказано в литературе, такие не кодирующие кодоны могут служить"сигналом" остановки синтеза полипептидной цепи. Если такая остановка произойдет, видимо, функция белка будет утрачена.